Jena is a Java framework for building Semantic Web applications. It provides a programmatic environment for RDF, RDFS and OWL, SPARQL and includes a rule-based inference engine.
The OWL API is a Java API and reference implmentation for creating, manipulating and serialising OWL Ontologies. The latest version of the API is focused towards OWL 2
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B. Omelayenko, und D. Fensel. Proceedings of the Second Internacional Conference on Electronic Commerce and Web Technologies (ECWEB-2001), Munich (Germany), Springer-Verlag, (2001)